Fyrir yngri sjúklinga með MDS getur verið raunhæft að ræða merg- eða blóðstofnfrumuígræðslu. Mergskipti með stofnfrumum frá öðrum einstakling (gjafa) getur verið lækning við MDS. Meðferðin getur þó verið mjög áhættusöm og ekki unnt að framkvæma hjá eldri einstaklingum. Ef mergskipti er mögulegur meðferðarkostur fyrir þig munt þú fá sérstakar upplýsingar um meðferðina. Annar möguleiki sem nú er til skoðunar í evrópskum rannsóknum er eigin stofnfrumu-ígræðsla (notaðar þínar eigin stofnfrumur). Í vissum tilvikum af MDS getur verið að eigin stofnfrumuígræðsla verði góður meðferðarkostur.